建設(shè)工程合同糾紛管轄權(quán)一般按照不動產(chǎn)糾紛確定管轄，即由不動產(chǎn)所在地人民法院管轄。但需注意專屬管轄的適用范圍和相關(guān)特殊規(guī)定。

1. 專屬管轄的規(guī)定：根據(jù)相關(guān)法律規(guī)定，建設(shè)工程施工合同糾紛按照不動產(chǎn)糾紛確定管轄。這是因為建設(shè)工程具有不可移動性，與不動產(chǎn)緊密相關(guān)。不動產(chǎn)糾紛屬于專屬管轄的范疇，專屬管轄具有排他性，排除了當事人協(xié)議選擇管轄法院的權(quán)利。例如，一個位于A市的建設(shè)工程項目，因該項目的建設(shè)工程合同發(fā)生糾紛，那么該糾紛就應由A市的不動產(chǎn)所在地法院管轄，當事人不能通過約定選擇其他地方的法院進行管轄。

2. 確定不動產(chǎn)所在地：不動產(chǎn)所在地的確定是明確管轄權(quán)的關(guān)鍵。對于建設(shè)工程而言，其不動產(chǎn)所在地就是建設(shè)工程項目的所在地。在實際操作中，要準確確定建設(shè)工程的地理位置，以確保向正確的法院提起訴訟。比如，一個跨越多個行政區(qū)劃的大型橋梁建設(shè)工程，就需要根據(jù)具體情況確定主要建設(shè)部分或者合同履行的核心區(qū)域所在的行政區(qū)劃，以此來確定管轄法院。

3. 相關(guān)合同類型適用：這里的建設(shè)工程合同糾紛不僅包括建設(shè)工程施工合同糾紛，還涵蓋了建設(shè)工程勘察合同糾紛、建設(shè)工程設(shè)計合同糾紛等。這些與建設(shè)工程相關(guān)的合同糾紛都統(tǒng)一按照不動產(chǎn)糾紛確定管轄。這是為了便于法院對案件進行審理和執(zhí)行，因為涉及建設(shè)工程的糾紛往往需要對現(xiàn)場進行勘查、鑒定等工作，由不動產(chǎn)所在地法院管轄更有利于案件的處理。

4. 特殊情況的處理：如果合同中存在多個與建設(shè)工程相關(guān)的事項，且涉及不同的地點，要根據(jù)具體糾紛的性質(zhì)和主要爭議點來確定管轄法院。如果是關(guān)于工程質(zhì)量的糾紛，通常以工程所在地法院管轄為宜；如果是關(guān)于設(shè)計費用的糾紛，可能需要綜合考慮設(shè)計工作的完成地等因素，但總體上還是要遵循不動產(chǎn)糾紛管轄的原則。

5. 管轄權(quán)異議的處理：當一方當事人對管轄權(quán)有異議時，可以在提交答辯狀期間提出。法院會對管轄權(quán)異議進行審查，如果異議成立，會將案件移送至有管轄權(quán)的法院；如果異議不成立，則會裁定駁回。當事人對裁定不服的，還可以在規(guī)定的期限內(nèi)上訴。

《中華人民共和國民事訴訟法》第三十四條規(guī)定，下列案件，由本條規(guī)定的人民法院專屬管轄：（一）因不動產(chǎn)糾紛提起的訴訟，由不動產(chǎn)所在地人民法院管轄；（二）因港口作業(yè)中發(fā)生糾紛提起的訴訟，由港口所在地人民法院管轄；（三）因繼承遺產(chǎn)糾紛提起的訴訟，由被繼承人死亡時住所地或者主要遺產(chǎn)所在地人民法院管轄。

《最高人民法院關(guān)于適用〈中華人民共和國民事訴訟法〉的解釋》第二十八條第二款規(guī)定，農(nóng)村土地承包經(jīng)營合同糾紛、房屋租賃合同糾紛、建設(shè)工程施工合同糾紛、政策性房屋買賣合同糾紛，按照不動產(chǎn)糾紛確定管轄。