證據(jù)不足不認(rèn)罪的情況下，檢察院可能會(huì)作出不起訴決定，也可能會(huì)退回補(bǔ)充偵查以進(jìn)一步完善證據(jù)。

1. 檢察院在審查案件時(shí)，如果認(rèn)為證據(jù)不足，不符合起訴的條件，會(huì)依法作出不起訴的決定。這是基于保障犯罪嫌疑人的合法權(quán)益以及維護(hù)司法公正的原則。不起訴決定意味著案件不會(huì)進(jìn)入審判程序，犯罪嫌疑人不會(huì)被起訴和審判。

2. 檢察院也可能會(huì)將案件退回公安機(jī)關(guān)補(bǔ)充偵查。這是因?yàn)楝F(xiàn)有證據(jù)雖然不足，但通過進(jìn)一步的偵查工作，有可能獲取到足夠的證據(jù)來支持起訴。補(bǔ)充偵查有法定的期限和次數(shù)限制。在退回補(bǔ)充偵查期間，公安機(jī)關(guān)會(huì)按照檢察院的要求，重新收集、固定證據(jù)，對(duì)案件進(jìn)行更深入的調(diào)查。補(bǔ)充偵查結(jié)束后，案件再次移送檢察院審查。如果補(bǔ)充偵查獲取的證據(jù)充分，檢察院可能會(huì)決定起訴;如果仍然證據(jù)不足，檢察院則應(yīng)當(dāng)作出不起訴決定。

需要注意的是，檢察院在辦理此類案件時(shí)，會(huì)嚴(yán)格遵循法律程序和證據(jù)規(guī)則，確保案件的處理合法、公正、準(zhǔn)確。犯罪嫌疑人不認(rèn)罪并不必然導(dǎo)致案件無法處理，關(guān)鍵還是在于證據(jù)的充分性和可靠性。

總之，證據(jù)不足不認(rèn)罪時(shí)，檢察院會(huì)根據(jù)具體的證據(jù)情況和法律規(guī)定，采取相應(yīng)的合法、合理的處理方式，以保障司法的公正和權(quán)威。

《中華人民共和國刑事訴訟法》 第一百七十五條

人民檢察院審查案件，可以要求公安機(jī)關(guān)提供法庭審判所必需的證據(jù)材料；認(rèn)為可能存在本法第五十六條規(guī)定的以非法方法收集證據(jù)情形的，可以要求其對(duì)證據(jù)收集的合法性作出說明。

人民檢察院審查案件，對(duì)于需要補(bǔ)充偵查的，可以退回公安機(jī)關(guān)補(bǔ)充偵查，也可以自行偵查。

對(duì)于補(bǔ)充偵查的案件，應(yīng)當(dāng)在一個(gè)月以內(nèi)補(bǔ)充偵查完畢。補(bǔ)充偵查以二次為限。補(bǔ)充偵查完畢移送人民檢察院后，人民檢察院重新計(jì)算審查起訴期限。

對(duì)于二次補(bǔ)充偵查的案件，人民檢察院仍然認(rèn)為證據(jù)不足，不符合起訴條件的，應(yīng)當(dāng)作出不起訴的決定。