如果工傷認定公司不配合提交資料，受傷職工可以自行申請工傷認定，通過勞動仲裁等途徑維護自身權益。

1. 自行收集證據(jù)并申請工傷認定。受傷職工應盡可能收集與工傷相關的證據(jù)，如勞動合同、工作證、工資條、考勤記錄、受傷現(xiàn)場的照片、證人證言、醫(yī)療診斷證明等。然后向當?shù)氐膭趧颖Ｕ闲姓块T提出工傷認定申請。

2. 向勞動監(jiān)察部門投訴。若公司故意不配合提交資料，職工可以向勞動監(jiān)察部門反映情況，要求其對公司的行為進行監(jiān)督和處理。勞動監(jiān)察部門有權對公司進行調(diào)查，并責令其改正違法行為。

3. 申請勞動仲裁。如果公司的不配合行為給職工造成了損失，職工可以向勞動仲裁機構申請仲裁，要求公司承擔相應的法律責任，如賠償因延誤工傷認定而導致的損失。

4. 提起訴訟。在勞動仲裁裁決后，如果職工或公司對裁決結果不服，可以向人民法院提起訴訟，通過法律途徑來解決爭議。

5. 尋求法律援助。如果職工在整個過程中感到困難或自身法律知識有限，可以向當?shù)氐姆稍鷻C構申請法律援助，獲得專業(yè)律師的幫助。

總之，面對公司不配合提交工傷認定資料的情況，受傷職工要堅定維護自己的合法權益，積極采取上述合法途徑，確保自身權益得到應有的保障。

《工傷保險條例》 第十七條

職工發(fā)生事故傷害或者按照職業(yè)病防治法規(guī)定被診斷、鑒定為職業(yè)病，所在單位應當自事故傷害發(fā)生之日或者被診斷、鑒定為職業(yè)病之日起30日內(nèi)，向統(tǒng)籌地區(qū)社會保險行政部門提出工傷認定申請。遇有特殊情況，經(jīng)報社會保險行政部門同意，申請時限可以適當延長。

用人單位未按前款規(guī)定提出工傷認定申請的，工傷職工或者其近親屬、工會組織在事故傷害發(fā)生之日或者被診斷、鑒定為職業(yè)病之日起1年內(nèi)，可以直接向用人單位所在地統(tǒng)籌地區(qū)社會保險行政部門提出工傷認定申請。

按照本條第一款規(guī)定應當由省級社會保險行政部門進行工傷認定的事項，根據(jù)屬地原則由用人單位所在地的設區(qū)的市級社會保險行政部門辦理。

用人單位未在本條第一款規(guī)定的時限內(nèi)提交工傷認定申請，在此期間發(fā)生符合本條例規(guī)定的工傷待遇等有關費用由該用人單位負擔。