工程款的認定通常需結合合同約定、實際施工情況、工程質量、相關憑證等多方面因素，依據(jù)法律規(guī)定和證據(jù)規(guī)則來確定。

1. 合同約定優(yōu)先：建設工程合同是認定工程款的重要依據(jù)。合同中一般會明確約定工程價款的計算方式，如固定總價、固定單價或按實結算等。如果合同對工程款的計價標準、支付方式、支付時間等有明確約定，且該約定不違反法律法規(guī)的強制性規(guī)定，那么在認定工程款時應首先遵循合同約定。例如，采用固定總價合同的，在合同沒有變更的情況下，應按照合同約定的總價認定工程款；采用固定單價合同的，則根據(jù)實際完成的工程量乘以約定單價來計算工程款。

2. 實際施工情況：即使有合同約定，實際施工情況也可能會對工程款產(chǎn)生影響。如果施工過程中發(fā)生了工程變更，包括設計變更、工程量增減等，那么需要對變更部分的工程款進行重新認定。對于變更部分的計價，如果合同有約定，按照約定執(zhí)行；如果沒有約定，可以參照建設行政主管部門發(fā)布的計價方法或者計價標準結算工程價款。同時，施工過程中的窩工、停工等情況也可能導致費用增加，這些費用也應在認定工程款時予以考慮。

3. 工程質量：工程質量合格是支付工程款的前提條件。如果工程質量不符合合同約定或相關標準，發(fā)包方有權要求承包方進行修復，修復費用應從工程款中扣除。如果工程質量嚴重不合格且無法修復，承包方可能無法獲得相應的工程款。對于一些有質量保修要求的工程，在保修期內如果出現(xiàn)質量問題，承包方應承擔保修責任，相應的費用也會影響工程款的最終認定。

4. 相關憑證：施工過程中的各種憑證，如施工圖紙、工程進度報表、工程量確認單、工程款支付憑證、材料采購發(fā)票等，都是認定工程款的重要證據(jù)。這些憑證可以證明實際完成的工程量、工程價款的支付情況以及各項費用的支出情況。例如，工程量確認單可以作為計算工程款的依據(jù)，工程款支付憑證可以證明發(fā)包方已經(jīng)支付的款項金額。

5. 鑒定評估：在一些情況下，如雙方對工程款的計算存在爭議且無法協(xié)商一致時，可以委托有資質的工程造價鑒定機構進行鑒定評估。鑒定機構會根據(jù)相關資料和規(guī)定，對工程價款進行鑒定，其鑒定結果可以作為認定工程款的參考依據(jù)。但鑒定過程需要遵循法定程序，確保鑒定結果的公正性和客觀性。

《中華人民共和國民法典》第七百九十三條規(guī)定，建設工程施工合同無效，但是建設工程經(jīng)驗收合格的，可以參照合同關于工程價款的約定折價補償承包人。建設工程施工合同無效，且建設工程經(jīng)驗收不合格的，按照以下情形處理：（一）修復后的建設工程經(jīng)驗收合格的，發(fā)包人可以請求承包人承擔修復費用；（二）修復后的建設工程經(jīng)驗收不合格的，承包人無權請求參照合同關于工程價款的約定折價補償。發(fā)包人對因建設工程不合格造成的損失有過錯的，應當承擔相應的責任。

《最高人民法院關于審理建設工程施工合同糾紛案件適用法律問題的解釋（一）》第十九條規(guī)定，當事人對建設工程的計價標準或者計價方法有約定的，按照約定結算工程價款。因設計變更導致建設工程的工程量或者質量標準發(fā)生變化，當事人對該部分工程價款不能協(xié)商一致的，可以參照簽訂建設工程施工合同時當?shù)亟ㄔO行政主管部門發(fā)布的計價方法或者計價標準結算工程價款。建設工程施工合同有效，但建設工程經(jīng)竣工驗收不合格的，依照民法典第五百七十七條規(guī)定處理。

第二十條規(guī)定，當事人對工程量有爭議的，按照施工過程中形成的簽證等書面文件確認。承包人能夠證明發(fā)包人同意其施工，但未能提供簽證文件證明工程量發(fā)生的，可以按照當事人提供的其他證據(jù)確認實際發(fā)生的工程量。