單位合并后，合同工資的發(fā)放通常會依據(jù)合并時(shí)的相關(guān)協(xié)議、新單位的工資政策以及原勞動合同的約定來執(zhí)行。

1. 查看合并協(xié)議：在單位合并過程中，通常會有關(guān)于員工待遇，包括工資發(fā)放的相關(guān)協(xié)議。

2. 遵循新單位工資政策：如果原單位員工被納入新的工資體系，那么工資的發(fā)放將按照新政策進(jìn)行。但一般會考慮到員工的既有權(quán)益，確保在合理范圍內(nèi)進(jìn)行調(diào)整。

3. 原勞動合同的約定：如果原勞動合同中對工資發(fā)放有明確且合法的約定，在單位合并的情況下，這些約定仍然具有法律效力。

4. 與工會或職工代表協(xié)商：為了保障員工的權(quán)益，新單位可能會與工會組織或者職工代表進(jìn)行協(xié)商，共同確定工資發(fā)放的具體方式和標(biāo)準(zhǔn)。

5. 考慮法律法規(guī)：工資的發(fā)放必須符合國家和地方的勞動法律法規(guī)。例如，不得低于當(dāng)?shù)刈畹凸べY標(biāo)準(zhǔn)，按時(shí)足額支付工資等。

6. 通知與公示：新單位應(yīng)當(dāng)將關(guān)于工資發(fā)放的決定及時(shí)通知員工，并進(jìn)行必要的公示，以確保員工知曉自己的權(quán)益和待遇。

7. 特殊情況處理：如果在合并過程中出現(xiàn)員工崗位變動、工作內(nèi)容調(diào)整等情況，工資的發(fā)放可能會根據(jù)新的崗位和工作要求進(jìn)行相應(yīng)的調(diào)整，但調(diào)整應(yīng)當(dāng)有合理的依據(jù)和程序。

《中華人民共和國勞動合同法》 第三十四條

用人單位發(fā)生合并或者分立等情況，原勞動合同繼續(xù)有效，勞動合同由承繼其權(quán)利和義務(wù)的用人單位繼續(xù)履行。

《中華人民共和國勞動合同法》 第三十五條

用人單位與勞動者協(xié)商一致，可以變更勞動合同約定的內(nèi)容。變更勞動合同，應(yīng)當(dāng)采用書面形式。

變更后的勞動合同文本由用人單位和勞動者各執(zhí)一份。